Sainte-Clotilde est une municipalité dans la municipalité régionale de comté de Les Jardins-de-Napierville au Québec, située dans la région administrative de la Montérégie.
La paroisse de Sainte-Clotilde fut érigée canonique en 1884 des suites de la cession d'une partie du territoire de Saint-Jean-Chrysostome. C'est l'année suivante que la municipalité de paroisse fut promulguée sous le nom de Sainte-Clothilde avant que son nom ne soit modifié, en 1984, sous sa forme actuelle.
L'origine du nom de cette municipalité serait due à la reine des Francs, Clotilde (vers 475-545), épouse de Clovis. Le choix de ce nom fut peut-être influencé par la ville septentrionale, Saint-Rémi, rendant hommage à Remi, évêque de Reims, qui baptisa l'époux de Clotilde.
Au recensement de 2006, on y a dénombré 1 608 habitants.